114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3444 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 179 aa  356  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 158 aa  85.1  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  36.09 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  31.11 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  31.11 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28.99 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  38.03 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  25.58 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  26.96 
 
 		 205 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  29.6 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  26.09 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  26.09 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  26.09 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  24.03 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 230 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 240 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 239 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 239 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  33.59 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  34.29 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  25.22 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  25.22 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.65 
 
 		 345 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.59 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  29.03 
 
 		 168 aa  42  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  43.64 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 229 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  32.53 
 
 		 152 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 138 aa  42  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 174 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 147 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.78 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  26.88 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 		 346 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  34.78 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 		 346 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 		 346 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  32.53 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>