156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0623 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  48.19 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  42 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  37.56 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.14 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  33.21 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  31.58 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  32.39 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.56 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  32.18 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  32.68 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.88 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.69 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.4 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  30.09 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  31.15 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  30.2 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.55 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.25 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.25 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.25 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.08 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.92 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.46 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  30.87 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.06 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  27.82 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  24.89 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  24.34 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  31 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  26.55 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.48 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  24.77 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  28.63 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  28.63 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.12 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  28.1 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.14 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  27.23 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  26.83 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.72 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  25.76 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  27.56 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.92 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.36 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  25.76 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  27.07 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  26.38 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  26.38 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  28.17 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  26.41 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  25 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.88 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  29.11 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.17 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  27.7 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.25 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  25.1 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.38 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  27.88 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.69 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.69 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.13 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  25.86 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.4 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.53 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.69 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.27 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  25 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.68 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.44 
 
 		 311 aa  52  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.67 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.37 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  26.75 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  23.92 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.34 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.85 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.29 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.2 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.5 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  23.77 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.35 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.58 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.56 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  23.9 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.85 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.28 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.79 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.85 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.85 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.61 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.41 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  21.94 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.27 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.42 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.42 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.68 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.67 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  24.57 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>