293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  40.14 
 
 
299 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  39.19 
 
 
308 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  40.6 
 
 
298 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  41.1 
 
 
321 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  36.21 
 
 
297 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  39.15 
 
 
358 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  31.56 
 
 
289 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  31.56 
 
 
289 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  31.56 
 
 
289 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  30.66 
 
 
286 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  30.95 
 
 
286 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.48 
 
 
302 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  30.05 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  31.7 
 
 
295 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.13 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 
292 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  28.77 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.99 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  33.48 
 
 
331 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.19 
 
 
353 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.96 
 
 
300 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.27 
 
 
295 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  32.66 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.18 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  31.03 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.21 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  23.55 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  35.42 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.63 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.79 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.03 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.19 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  30.39 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0713  hypothetical protein  26.95 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.689852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  38.46 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.3 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.67 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.96 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  32.38 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.35 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  32.38 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  32.38 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.3 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.1 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.79 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.88 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30.43 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  29.57 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  23.08 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  32.31 
 
 
345 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.35 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.18 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.36 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.64 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  29.06 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  29.76 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.78 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.36 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  27.36 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.27 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  28.29 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  29.41 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  29.41 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  29.41 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  31.69 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.7 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  29.8 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  24.26 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  28.44 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  32.24 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  28.94 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  29.3 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  33.51 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.35 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  25.59 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  27.43 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  28.35 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  29.09 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  31.69 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  29.94 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  30.52 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  27.2 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  23.53 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  27.95 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  31.41 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.41 
 
 
447 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  31.46 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  30.05 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  27.56 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  40.86 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  30.05 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  30.05 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  30.77 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>