More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5597 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  95.45 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  33.33 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.94 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5169  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
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NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 371 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 156 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
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NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
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NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
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NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
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NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
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