More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3623 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3529  porin  92.82 
 
 		 376 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  100 
 
 		 372 aa  742    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  94.62 
 
 		 372 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  98.12 
 
 		 372 aa  730    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  93.62 
 
 		 376 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  93.28 
 
 		 372 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  76.16 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  50.86 
 
 		 370 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  38.29 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.05 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  33.42 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  32.25 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  32.43 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  32.43 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  32.43 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  31.71 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.15 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  34.62 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  32.24 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  34.23 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  32.34 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  32.88 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  32.33 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  29.64 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  34.26 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  34.26 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  34.15 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  34.15 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  34.26 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  34.26 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  34.15 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  32.3 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  32.3 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  32.49 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  30.77 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  33.52 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  30.77 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  31.83 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  31.88 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  30.77 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  33.15 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  30.77 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.59 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  31.92 
 
 		 389 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.22 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  32.92 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  38.91 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  31.2 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  30.49 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  37.67 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  34.05 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  33.04 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  32.95 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  32.39 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  32.88 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  42.51 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.3 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  31.71 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  31.65 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  33.24 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  31.27 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.1 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  30.08 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  31.65 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  31.27 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  32.58 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  31.78 
 
 		 405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  33.24 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  30.73 
 
 		 350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  33.24 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  30.62 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  30.46 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  39.53 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  29.25 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  32.58 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  32.06 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  30.72 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  32.87 
 
 		 379 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.58 
 
 		 449 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  31.38 
 
 		 350 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  32.57 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.68 
 
 		 369 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  31.85 
 
 		 385 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.3 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.3 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.02 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  30.03 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  33.52 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  30.39 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.11 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  32.65 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.11 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.58 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.11 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  29.33 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  29.31 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  33.33 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  33.81 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.58 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>