More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2231 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  100 
 
 
608 aa  1160    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.98 
 
 
606 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  59.08 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  55.02 
 
 
605 aa  552  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  51.86 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  52.68 
 
 
602 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  51.28 
 
 
608 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  47.96 
 
 
589 aa  505  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  49.41 
 
 
613 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  47.73 
 
 
726 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
591 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  49.25 
 
 
597 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
671 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  50.93 
 
 
625 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.23 
 
 
617 aa  452  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  51.02 
 
 
625 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  47.57 
 
 
638 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  43.91 
 
 
609 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  45.56 
 
 
584 aa  425  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.27 
 
 
730 aa  392  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  39.16 
 
 
984 aa  266  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.39 
 
 
581 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  35.19 
 
 
631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  28.01 
 
 
582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  32.54 
 
 
600 aa  241  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  27.27 
 
 
585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.45 
 
 
593 aa  229  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.66 
 
 
1257 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.1 
 
 
577 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.86 
 
 
1522 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  26.05 
 
 
596 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  31.84 
 
 
601 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  31.78 
 
 
606 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  25.88 
 
 
598 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  26.8 
 
 
593 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  34.68 
 
 
1301 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  34 
 
 
589 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  27.33 
 
 
606 aa  224  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.63 
 
 
652 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.97 
 
 
614 aa  224  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  28.15 
 
 
604 aa  224  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  27.7 
 
 
593 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  32.56 
 
 
604 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  33.15 
 
 
650 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  26.65 
 
 
580 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  33.15 
 
 
650 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.27 
 
 
589 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  30.8 
 
 
634 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  27.27 
 
 
594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.83 
 
 
636 aa  220  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.49 
 
 
622 aa  220  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  29.68 
 
 
586 aa  220  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  36.22 
 
 
1321 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  29.67 
 
 
585 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  32.25 
 
 
611 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.76 
 
 
591 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  33.85 
 
 
615 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  29.58 
 
 
587 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  25.89 
 
 
584 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  26.68 
 
 
589 aa  216  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.3 
 
 
582 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  28.9 
 
 
584 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  32.27 
 
 
633 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  29.28 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  29.62 
 
 
576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  25.89 
 
 
588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  27.16 
 
 
614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  34.28 
 
 
577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  28.09 
 
 
589 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.01 
 
 
583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  28.29 
 
 
575 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  26.9 
 
 
581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  32.59 
 
 
641 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.1 
 
 
586 aa  214  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  33.02 
 
 
641 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  28.24 
 
 
577 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.58 
 
 
579 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  34.87 
 
 
578 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.69 
 
 
596 aa  213  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  34.09 
 
 
602 aa  213  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  32.53 
 
 
672 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  26.01 
 
 
583 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  26.58 
 
 
586 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  31.12 
 
 
579 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.74 
 
 
582 aa  213  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.62 
 
 
601 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  26.18 
 
 
592 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  31.7 
 
 
581 aa  212  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
1218 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.36 
 
 
583 aa  212  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.85 
 
 
579 aa  212  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  31.26 
 
 
581 aa  212  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.54 
 
 
572 aa  212  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  30.11 
 
 
572 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  28.54 
 
 
572 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.79 
 
 
583 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  28.54 
 
 
572 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.53 
 
 
588 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.72 
 
 
586 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  29.64 
 
 
639 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>