276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0538 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  49.57 
 
 		 224 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  49.13 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 218 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  44.5 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  42.92 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  39.47 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  49.55 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  64.06 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  56.86 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  45.57 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  43.84 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  45.9 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  45.9 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  45.9 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  48.08 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  45.9 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  45.9 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  46.55 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  42.62 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  43.48 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  50 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 318 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 318 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 318 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 318 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  27.39 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  40.98 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  54.35 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>