196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6480 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  84.62 
 
 		 387 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  97.44 
 
 		 390 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  84.62 
 
 		 387 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 390 aa  794    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  84.87 
 
 		 387 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  81.07 
 
 		 387 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  54.02 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  48.42 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  49.09 
 
 		 382 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  47.89 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  49.6 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  50.13 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  47.45 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  49.42 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  48.84 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  47.09 
 
 		 384 aa  339  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  48.12 
 
 		 346 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  47.89 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  51.3 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  45.38 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  44.5 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  47.84 
 
 		 385 aa  322  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  47.06 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  47.15 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  47.49 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  45.19 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  48.12 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  41.96 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  44.11 
 
 		 392 aa  312  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  49 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  49 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  45.48 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  48.3 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  46.61 
 
 		 384 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  46.57 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  47.66 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  41.88 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  46.86 
 
 		 361 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  46.28 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  48.77 
 
 		 321 aa  292  7e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 355 aa  292  8e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  43.8 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  41.53 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 		 356 aa  290  4e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  42.74 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  45.35 
 
 		 350 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  46.53 
 
 		 317 aa  282  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  48.31 
 
 		 341 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  43.17 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  42.25 
 
 		 360 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  43.39 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  44.67 
 
 		 359 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.97 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  38.9 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.4 
 
 		 353 aa  269  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 357 aa  265  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  43.1 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  40.29 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  42.69 
 
 		 345 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  35.16 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  42.7 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  42.47 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  42.35 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  43.71 
 
 		 376 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 340 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  38.03 
 
 		 377 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  41.14 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  41.14 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  39.84 
 
 		 363 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  40.86 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  40.55 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 350 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  39 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  36.07 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 		 344 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  34.18 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  38.23 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.65 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  36.78 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  36.78 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  37.68 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 346 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 346 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>