More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4524 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  100 
 
 		 322 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  97.52 
 
 		 322 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  95.65 
 
 		 322 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  95.65 
 
 		 322 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  95.65 
 
 		 322 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  95.65 
 
 		 322 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  86.44 
 
 		 320 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  86.44 
 
 		 320 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  86.75 
 
 		 320 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  86.56 
 
 		 320 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  84.91 
 
 		 322 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  74.33 
 
 		 325 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  59.87 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  60.26 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  59.94 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  59.94 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  59.42 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  56.23 
 
 		 322 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  53.9 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  55.59 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  54.98 
 
 		 321 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  55.12 
 
 		 321 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  55.15 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  51.64 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  53.27 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  50.49 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  50.16 
 
 		 316 aa  285  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  51.33 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  49.19 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  50.8 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  48.54 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  51.16 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  49.32 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  51.84 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  48.79 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  48.44 
 
 		 306 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  51.31 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  45.9 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  48.18 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  48.5 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  44.93 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  48.5 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  48.17 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  46.23 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  44.86 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  44.52 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  43.92 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  42.22 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  42.54 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  45.81 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  41.98 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  44.19 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  41.75 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  42.43 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  41.49 
 
 		 317 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  41.49 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  45.16 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  44.84 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  42.41 
 
 		 329 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  43.17 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  42.67 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  43.42 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  42.3 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  39.42 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  43.42 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  40.47 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  42 
 
 		 321 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  43.32 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  41.18 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  39.81 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  41.72 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  38.39 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  41.12 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  38.98 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  39.16 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  42.24 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  40.66 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  42.24 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  40.66 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  42.24 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  40.66 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  39.3 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40.19 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  40.58 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  41.64 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40.19 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40.19 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  36.39 
 
 		 412 aa  196  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  41.99 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>