More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3658 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  45.77 
 
 		 955 aa  800    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  43.54 
 
 		 963 aa  775    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  73.41 
 
 		 929 aa  1361    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  49.58 
 
 		 949 aa  909    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  49.32 
 
 		 942 aa  904    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  44.15 
 
 		 975 aa  775    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  43.51 
 
 		 951 aa  744    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  83.3 
 
 		 932 aa  1598    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  100 
 
 		 960 aa  1952    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  46.56 
 
 		 964 aa  815    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  44.48 
 
 		 963 aa  796    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  42.55 
 
 		 961 aa  666    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.82 
 
 		 961 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  48.46 
 
 		 967 aa  880    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  64.61 
 
 		 947 aa  1221    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  48.92 
 
 		 966 aa  891    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  49.25 
 
 		 665 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  78.73 
 
 		 363 aa  581  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  44.66 
 
 		 921 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  44.28 
 
 		 915 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  43.83 
 
 		 915 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  43.83 
 
 		 916 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  29.93 
 
 		 555 aa  206  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.73 
 
 		 572 aa  204  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  30.29 
 
 		 584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.81 
 
 		 584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  30.49 
 
 		 554 aa  197  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.03 
 
 		 988 aa  196  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.08 
 
 		 933 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  29.97 
 
 		 1138 aa  191  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 		 962 aa  188  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 1129 aa  187  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.81 
 
 		 969 aa  187  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 1145 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1144 aa  184  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.38 
 
 		 835 aa  184  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.37 
 
 		 966 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.92 
 
 		 1147 aa  179  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.32 
 
 		 941 aa  176  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.32 
 
 		 941 aa  176  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.13 
 
 		 1116 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.61 
 
 		 972 aa  174  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.83 
 
 		 969 aa  174  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.01 
 
 		 801 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  28.62 
 
 		 1062 aa  171  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.5 
 
 		 805 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  28.5 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  31.09 
 
 		 964 aa  166  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  27.02 
 
 		 927 aa  164  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25.88 
 
 		 971 aa  164  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  26.24 
 
 		 1043 aa  161  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.23 
 
 		 877 aa  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.1 
 
 		 1160 aa  156  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.45 
 
 		 1057 aa  154  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  28.75 
 
 		 1170 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.18 
 
 		 1170 aa  152  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.28 
 
 		 1167 aa  152  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1172 aa  151  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 937 aa  150  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  27.91 
 
 		 1038 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.24 
 
 		 1167 aa  148  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.26 
 
 		 1167 aa  148  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 1137 aa  148  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  27.87 
 
 		 1044 aa  147  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  27.74 
 
 		 1136 aa  147  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  27.81 
 
 		 1169 aa  146  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.65 
 
 		 1165 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1169 aa  144  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.92 
 
 		 900 aa  144  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  26.36 
 
 		 1095 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  26.81 
 
 		 1201 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  26.81 
 
 		 1201 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.99 
 
 		 1170 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  24.51 
 
 		 1049 aa  141  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.04 
 
 		 1170 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  26.29 
 
 		 894 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  27.41 
 
 		 1160 aa  135  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  27.86 
 
 		 1194 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.97 
 
 		 1212 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.33 
 
 		 1028 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  26.83 
 
 		 829 aa  131  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  33.19 
 
 		 467 aa  131  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  39.59 
 
 		 560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  39.09 
 
 		 560 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  39.09 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  39.09 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  39.09 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  39.09 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  39.09 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  39.09 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  39.09 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  38.58 
 
 		 560 aa  128  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.11 
 
 		 1168 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  27.24 
 
 		 919 aa  127  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  25.26 
 
 		 1082 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  25.91 
 
 		 1058 aa  124  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.52 
 
 		 1013 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  26.02 
 
 		 1046 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  36 
 
 		 669 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>