126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1642 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  100 
 
 
529 aa  1085    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  65.49 
 
 
498 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  46.21 
 
 
503 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  42.66 
 
 
528 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  48.35 
 
 
491 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  33.53 
 
 
521 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  33.47 
 
 
535 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  32.02 
 
 
535 aa  249  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.14 
 
 
534 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.14 
 
 
534 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  31.9 
 
 
849 aa  226  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  30.89 
 
 
541 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  30.86 
 
 
558 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  29.67 
 
 
543 aa  213  9e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  29.18 
 
 
581 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  30.12 
 
 
581 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  27.93 
 
 
581 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  28.97 
 
 
563 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  29.68 
 
 
550 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  29.51 
 
 
557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  29.15 
 
 
588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  28.71 
 
 
602 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  29.02 
 
 
586 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  28.46 
 
 
530 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  30.15 
 
 
583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  29.86 
 
 
535 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  28.4 
 
 
537 aa  186  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  28.21 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  29.45 
 
 
535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  29.53 
 
 
552 aa  180  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  27.46 
 
 
546 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  29.76 
 
 
553 aa  177  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.31 
 
 
561 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  26.92 
 
 
546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  27.01 
 
 
562 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  27.01 
 
 
562 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  27.99 
 
 
604 aa  170  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  26.46 
 
 
562 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  26.46 
 
 
562 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  29.9 
 
 
540 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  25.98 
 
 
562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  28.01 
 
 
545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  26.92 
 
 
555 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  27.88 
 
 
565 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  26.42 
 
 
542 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  26.42 
 
 
542 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.05 
 
 
510 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  27.89 
 
 
540 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  25.64 
 
 
556 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  26.07 
 
 
564 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  26.67 
 
 
566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  26.53 
 
 
606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  38.43 
 
 
229 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  25.49 
 
 
561 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  24.17 
 
 
564 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  24.92 
 
 
602 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  26.44 
 
 
606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  25.83 
 
 
568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  26.23 
 
 
611 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  26.41 
 
 
585 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.24 
 
 
580 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  24.23 
 
 
561 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  24.05 
 
 
574 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  27.01 
 
 
572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.14 
 
 
593 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  25.05 
 
 
581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  24.01 
 
 
569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  27.78 
 
 
504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  24.51 
 
 
574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  34.44 
 
 
169 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  25.52 
 
 
577 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  25.05 
 
 
565 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  25.8 
 
 
573 aa  127  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  25.65 
 
 
569 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  24.79 
 
 
577 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  24.42 
 
 
565 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  25.44 
 
 
579 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  27.61 
 
 
489 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  26.4 
 
 
544 aa  116  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  28.09 
 
 
551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  27.24 
 
 
489 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  27.24 
 
 
489 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  24.77 
 
 
581 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  24.18 
 
 
571 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  23.48 
 
 
356 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  22.43 
 
 
590 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  22.43 
 
 
590 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  22.43 
 
 
590 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.79 
 
 
591 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.79 
 
 
562 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  26.87 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.79 
 
 
590 aa  97.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  22.83 
 
 
584 aa  96.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  26.38 
 
 
525 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  26.38 
 
 
523 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.6 
 
 
455 aa  94  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  23.06 
 
 
563 aa  94  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  23.06 
 
 
563 aa  94  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  24.07 
 
 
581 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  24.81 
 
 
569 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>