More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1824 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2154  ABC transporter  87.58 
 
 
594 aa  884    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513956  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  78.39 
 
 
594 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0791  putative ABC transporter, ATP-binding protein  87.75 
 
 
594 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1824  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
590 aa  1127    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.145117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  78.9 
 
 
587 aa  816    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  78.73 
 
 
588 aa  810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0881  putative ABC transporter, ATP-binding protein  87.88 
 
 
594 aa  886    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  78.73 
 
 
588 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09320  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.93 
 
 
574 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.955623  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0878  ABC transporter ATP-binding protein  61.96 
 
 
574 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0730898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0844  ABC transporter component  55.26 
 
 
569 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  35.83 
 
 
575 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.16 
 
 
596 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
571 aa  253  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  38.68 
 
 
581 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.75 
 
 
581 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  37.87 
 
 
579 aa  237  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.65 
 
 
577 aa  233  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  34.31 
 
 
582 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  34.95 
 
 
577 aa  233  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.91 
 
 
607 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  37.78 
 
 
601 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  32.22 
 
 
600 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  36.32 
 
 
584 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
578 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  31.71 
 
 
576 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  31.56 
 
 
582 aa  198  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  31.05 
 
 
606 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.71 
 
 
581 aa  193  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  31.15 
 
 
627 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  26.21 
 
 
602 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
588 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  29.89 
 
 
581 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  27.16 
 
 
615 aa  187  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  32.69 
 
 
565 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  25.39 
 
 
587 aa  187  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  25.39 
 
 
587 aa  187  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  29.94 
 
 
595 aa  186  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  33.26 
 
 
622 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  28.65 
 
 
585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  36.03 
 
 
595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  29.61 
 
 
619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.28 
 
 
594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.47 
 
 
585 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  31.86 
 
 
661 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.61 
 
 
608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.46 
 
 
579 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.98 
 
 
583 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
596 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  30.21 
 
 
596 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  28.6 
 
 
588 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  30.23 
 
 
592 aa  181  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  33.12 
 
 
593 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  27.78 
 
 
590 aa  181  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  29.13 
 
 
576 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
592 aa  180  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  29 
 
 
606 aa  180  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.43 
 
 
572 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.59 
 
 
1228 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  31.78 
 
 
600 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.89 
 
 
606 aa  177  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  29.29 
 
 
591 aa  177  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
614 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.4 
 
 
574 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.18 
 
 
598 aa  177  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.1 
 
 
579 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.18 
 
 
574 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.68 
 
 
580 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.22 
 
 
614 aa  176  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.27 
 
 
597 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  30.04 
 
 
599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.02 
 
 
598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.32 
 
 
619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  28.73 
 
 
581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.99 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.76 
 
 
600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.35 
 
 
721 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  33.33 
 
 
615 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  28.27 
 
 
575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3109  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.516778  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.32 
 
 
622 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  29.7 
 
 
616 aa  174  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.39 
 
 
597 aa  173  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.36 
 
 
627 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.78 
 
 
628 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  28.4 
 
 
583 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  39.26 
 
 
683 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.22 
 
 
587 aa  173  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.8 
 
 
577 aa  173  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.8 
 
 
627 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.94 
 
 
590 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.24 
 
 
618 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.78 
 
 
597 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.66 
 
 
574 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.33 
 
 
567 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  29.03 
 
 
677 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  30.18 
 
 
672 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.22 
 
 
579 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  34.86 
 
 
646 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.95 
 
 
567 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>