More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8321 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  100 
 
 		 380 aa  765    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  42.94 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  39.89 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  43.89 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  41.48 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  41.62 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 371 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  37.01 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  38.07 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  41.02 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  36.16 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  32.48 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.29 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 960 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.8 
 
 		 374 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 500 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  27.22 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 496 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  26.26 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 492 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.75 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.63 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.08 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  24.76 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  25.77 
 
 		 684 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 984 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25.85 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 983 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  25.98 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  24.51 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.54 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  21.97 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.96 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  21.79 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.07 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.35 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  26.2 
 
 		 652 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.43 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  25.33 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.07 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  31.72 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  21.79 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  21.79 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  25.8 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  25.65 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.82 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  31.72 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  23.78 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  20.9 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  23.45 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  21.13 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  31.29 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.55 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>