More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3072 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.18 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  35.18 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  30.62 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 220 aa  97.8  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.99 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  29.81 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  30.92 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  31.22 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.81 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.02 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  29.67 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  32.23 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  31.16 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  31.07 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 303 aa  92.4  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.86 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 230 aa  92  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  29.38 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 241 aa  91.3  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 226 aa  91.3  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  33.84 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  30.81 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.52 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 237 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.99 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  29.38 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  30.61 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  30.24 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.3 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.52 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  29.72 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>