90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4173 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  35.29 
 
 		 1703 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1748 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  37.69 
 
 		 1642 aa  801    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  33.33 
 
 		 1649 aa  675    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  32.32 
 
 		 2570 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  35.22 
 
 		 1702 aa  766    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  44.71 
 
 		 1925 aa  999    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  34.74 
 
 		 1417 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1575 aa  3214    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  34.63 
 
 		 1697 aa  741    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 1693 aa  738    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 1516 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  89.97 
 
 		 1606 aa  2848    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  34.37 
 
 		 1700 aa  746    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  34.41 
 
 		 1706 aa  705    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  33.04 
 
 		 2077 aa  768    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  36.69 
 
 		 1956 aa  796    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  31.03 
 
 		 2098 aa  671    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  36.25 
 
 		 1669 aa  777    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  37.21 
 
 		 1669 aa  794    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  34.97 
 
 		 1701 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  34.81 
 
 		 1697 aa  755    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  34.94 
 
 		 1726 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  29.46 
 
 		 1932 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  28.9 
 
 		 1934 aa  613  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 1594 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  30.08 
 
 		 1722 aa  532  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.27 
 
 		 2274 aa  524  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  32.59 
 
 		 1211 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 1674 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  25.93 
 
 		 2117 aa  473  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  35.82 
 
 		 976 aa  459  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  32.82 
 
 		 2005 aa  422  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  30.82 
 
 		 761 aa  253  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  33.66 
 
 		 763 aa  242  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  30.6 
 
 		 766 aa  206  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 577 aa  178  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  40.61 
 
 		 470 aa  162  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  35.97 
 
 		 526 aa  147  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  34.06 
 
 		 339 aa  119  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  29.02 
 
 		 341 aa  105  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  29.41 
 
 		 341 aa  103  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  24.2 
 
 		 1379 aa  98.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  23.08 
 
 		 678 aa  95.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  27.44 
 
 		 1328 aa  80.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  46.67 
 
 		 284 aa  80.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 919 aa  57.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  37.36 
 
 		 572 aa  55.5  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  29.6 
 
 		 468 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3080  helicase related protein  32.09 
 
 		 1786 aa  55.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1170 aa  52.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  37.35 
 
 		 1116 aa  52  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  26.04 
 
 		 254 aa  50.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  29.5 
 
 		 527 aa  49.7  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.65 
 
 		 1147 aa  48.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  23.93 
 
 		 1165 aa  48.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  25.14 
 
 		 1168 aa  48.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 986 aa  48.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.79 
 
 		 894 aa  48.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.04 
 
 		 952 aa  48.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  21.37 
 
 		 966 aa  48.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  33.71 
 
 		 560 aa  48.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  35.53 
 
 		 922 aa  47.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  27.82 
 
 		 903 aa  47.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  30.93 
 
 		 900 aa  47  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  28.14 
 
 		 569 aa  47  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  35.9 
 
 		 584 aa  47  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  28.28 
 
 		 573 aa  46.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.9 
 
 		 595 aa  46.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  40 
 
 		 541 aa  46.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  26.91 
 
 		 988 aa  46.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  25.85 
 
 		 933 aa  46.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  23.93 
 
 		 971 aa  45.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  31.29 
 
 		 449 aa  45.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  28.89 
 
 		 872 aa  45.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  31.94 
 
 		 1143 aa  45.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 1002 aa  45.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  28.03 
 
 		 466 aa  45.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.95 
 
 		 1169 aa  45.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.73 
 
 		 1212 aa  45.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>