278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2181 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  71.54 
 
 		 663 aa  943    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 663 aa  1344    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 683 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 675 aa  286  9e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  37.58 
 
 		 344 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  42.43 
 
 		 337 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  36.34 
 
 		 325 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  38.87 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  38.39 
 
 		 361 aa  180  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 331 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  40.31 
 
 		 313 aa  177  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  40.55 
 
 		 352 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  38.53 
 
 		 318 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  35.69 
 
 		 337 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  35.96 
 
 		 318 aa  170  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  38.92 
 
 		 315 aa  170  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  33.23 
 
 		 321 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  36.14 
 
 		 327 aa  169  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  36.97 
 
 		 361 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  35.91 
 
 		 319 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  35.35 
 
 		 329 aa  167  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  36.22 
 
 		 331 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  35.2 
 
 		 340 aa  161  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  35.13 
 
 		 321 aa  161  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  37.89 
 
 		 320 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  35.78 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  29.15 
 
 		 699 aa  159  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  35.98 
 
 		 335 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  34.37 
 
 		 326 aa  157  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  36.62 
 
 		 323 aa  157  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  37.84 
 
 		 335 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  31.92 
 
 		 326 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  37.29 
 
 		 361 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  37.13 
 
 		 330 aa  153  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  31.5 
 
 		 343 aa  153  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  36.23 
 
 		 327 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  35.15 
 
 		 323 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  35.96 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  34.91 
 
 		 326 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  34.91 
 
 		 326 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  34.91 
 
 		 326 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  31.89 
 
 		 317 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  35.1 
 
 		 332 aa  144  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  33.75 
 
 		 331 aa  143  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  37.12 
 
 		 327 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  37.63 
 
 		 326 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  34.06 
 
 		 325 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  34.06 
 
 		 325 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  36.97 
 
 		 330 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  32.92 
 
 		 328 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  34.2 
 
 		 327 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  33.44 
 
 		 325 aa  137  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  34.85 
 
 		 325 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  32.92 
 
 		 331 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  32.71 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  37.28 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  31.44 
 
 		 334 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  33.23 
 
 		 324 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  31.1 
 
 		 330 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  36.04 
 
 		 348 aa  118  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  27.57 
 
 		 664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  29.24 
 
 		 341 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  24.25 
 
 		 687 aa  100  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  29.26 
 
 		 368 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  31.86 
 
 		 367 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  31.6 
 
 		 369 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  31.55 
 
 		 364 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.1 
 
 		 351 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0583  hypothetical protein  27.63 
 
 		 598 aa  94  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.692226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  30.69 
 
 		 334 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.55 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  27.27 
 
 		 327 aa  83.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.59 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  28.29 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  23.72 
 
 		 301 aa  72  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  32.07 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  26.01 
 
 		 320 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.94 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  31.22 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  26.01 
 
 		 320 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.78 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  25.36 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  26.01 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  26.01 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.03 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.57 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  31.22 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.65 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  27.72 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.54 
 
 		 318 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.22 
 
 		 298 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.7 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  40 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  20 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  24.1 
 
 		 324 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.36 
 
 		 322 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 335 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.38 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>