More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0077 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  100 
 
 		 366 aa  735    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  55.23 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  50.97 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  48.98 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  44.81 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  45.68 
 
 		 392 aa  242  9e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  34.89 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  34.44 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  33.16 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  34.03 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  33.78 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  28.98 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  28.98 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  28.98 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  34.05 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  33.85 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  32.52 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  32.45 
 
 		 389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  32.54 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  35.04 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  30.77 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  30.38 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  28.35 
 
 		 371 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  31.08 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  31.08 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  32.38 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  31.98 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  31.98 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  27.39 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  31.35 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  30.18 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  31.48 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  29.3 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  29.77 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  27.51 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  31.38 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  28.15 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  27.49 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  27.49 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  27.57 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  26.83 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  26.83 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  26.83 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  27.57 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  26.95 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  26.95 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  27.57 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  27.57 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  27.57 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  31.32 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  27.3 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  30.51 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  25.99 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  27.39 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  26.44 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  28.12 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 398 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  25.54 
 
 		 373 aa  99.4  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  31.56 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 398 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  28.57 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.81 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  27.21 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.93 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.93 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.13 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.23 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.76 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.12 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.67 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.78 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.67 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.67 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  29.03 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>