279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1252 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  100 
 
 
324 aa  649    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.3 
 
 
288 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.3 
 
 
288 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.55 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  26.46 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.46 
 
 
289 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.46 
 
 
289 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.46 
 
 
289 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.46 
 
 
289 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.46 
 
 
289 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.46 
 
 
289 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.71 
 
 
289 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.68 
 
 
277 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  26.06 
 
 
283 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.43 
 
 
392 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.35 
 
 
283 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.46 
 
 
276 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.08 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.79 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  22.41 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  26.18 
 
 
322 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.87 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.24 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.68 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.25 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  23.96 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  23.63 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.38 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  23.96 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  24.73 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  22.06 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  25.72 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  22.97 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  22.7 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  22.7 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.89 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  24.2 
 
 
374 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  22.38 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  25.78 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  25 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  21.79 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  23.1 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  23.78 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0847  ribonuclease BN, putative  26.09 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.44 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  21.17 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  27.43 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.2 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  23.77 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  25.19 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  22.06 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  23.7 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  22.51 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  22.51 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  22.51 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  23.44 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  22.48 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  23.24 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  20.53 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25.75 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  21.86 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  21.1 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  25.56 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  23.61 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  21.53 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  21.78 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  25.42 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  21.2 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  22.42 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  21.2 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  22.74 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  21.72 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  22.58 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  20.5 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  20.32 
 
 
402 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  23.02 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  24.73 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  21.86 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  25.09 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  27.81 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  23.02 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  21.77 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  21.77 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  24.2 
 
 
359 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  23.38 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  21.99 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.53 
 
 
349 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  26.47 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  25.18 
 
 
307 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  22.07 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  29.6 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  30.28 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2678  ribonuclease BN  25.6 
 
 
266 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00324748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  23.21 
 
 
386 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  20.38 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  22.34 
 
 
279 aa  60.1  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  22.46 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>