More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6206 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 536 aa  1077    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  63.99 
 
 		 542 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  66.02 
 
 		 540 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  68.16 
 
 		 539 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  67.8 
 
 		 532 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  76.8 
 
 		 662 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  67.86 
 
 		 540 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  69.65 
 
 		 792 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  66.32 
 
 		 651 aa  524  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  46.3 
 
 		 521 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  47.23 
 
 		 703 aa  312  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  35.04 
 
 		 559 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  39.91 
 
 		 652 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  40.54 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  35.63 
 
 		 762 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  35.25 
 
 		 425 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  35.8 
 
 		 854 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  35.66 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  36.32 
 
 		 400 aa  200  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  36.34 
 
 		 1271 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  35.73 
 
 		 455 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  34.03 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  33.99 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  32.6 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  32.82 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1080 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  32.73 
 
 		 763 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.3 
 
 		 868 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.88 
 
 		 869 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.26 
 
 		 674 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.25 
 
 		 674 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.03 
 
 		 674 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 868 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  30.8 
 
 		 674 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  30.8 
 
 		 674 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  30.8 
 
 		 674 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.96 
 
 		 867 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  30.8 
 
 		 674 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 		 674 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  32.81 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  28.43 
 
 		 563 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  29.53 
 
 		 868 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  29.26 
 
 		 868 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  30.79 
 
 		 674 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 868 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  33.42 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  29.01 
 
 		 868 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  30.19 
 
 		 972 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.7 
 
 		 674 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  30.7 
 
 		 674 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  27.78 
 
 		 848 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  31.81 
 
 		 675 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  28.49 
 
 		 848 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  28.79 
 
 		 855 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 863 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.06 
 
 		 639 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  31.88 
 
 		 505 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  31.5 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 		 652 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  32.32 
 
 		 373 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  29.1 
 
 		 388 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.12 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  31.29 
 
 		 1362 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  30.9 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.46 
 
 		 372 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  31.37 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  47.06 
 
 		 613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.51 
 
 		 499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  26.21 
 
 		 657 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  29.18 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  28.8 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  50.49 
 
 		 507 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 1578 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 465 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  45.93 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  30.58 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  31.56 
 
 		 637 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  43.7 
 
 		 468 aa  97.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  30.03 
 
 		 1146 aa  97.4  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  30 
 
 		 861 aa  97.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  26 
 
 		 634 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  28.81 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  49.57 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 1782 aa  93.6  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  29.75 
 
 		 997 aa  93.6  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.75 
 
 		 1132 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 364 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 		 1443 aa  90.9  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  42.73 
 
 		 466 aa  90.5  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 552 aa  90.5  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 1127 aa  90.1  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  39.86 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  27.69 
 
 		 1127 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  27.67 
 
 		 772 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 1246 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  38.78 
 
 		 562 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  27.38 
 
 		 1127 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 1127 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  27.36 
 
 		 760 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>