More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4020 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  98.25 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4661  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.384248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 222 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  26.51 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  51.85 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  22.12 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  51.85 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  51.85 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  51.85 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  51.85 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  47.37 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  47.37 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  42.67 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  37.68 
 
 		 112 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  42.65 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>