More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1435 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
344 aa  689    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  44.58 
 
 
344 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  46.18 
 
 
352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  48.28 
 
 
345 aa  271  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  41.77 
 
 
338 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  40.71 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  39.31 
 
 
345 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  39.38 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  41.96 
 
 
335 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  38.23 
 
 
333 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  39.27 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  39.49 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  40.92 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  39.64 
 
 
347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  43 
 
 
351 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  36.03 
 
 
337 aa  205  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  41.26 
 
 
370 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  34.19 
 
 
373 aa  202  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  36.56 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 
357 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 
364 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  36.27 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 
358 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  35.82 
 
 
362 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 
363 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  33.96 
 
 
424 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 
363 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  36.17 
 
 
333 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  38.22 
 
 
376 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 
356 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  34.8 
 
 
356 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.8 
 
 
356 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  38.36 
 
 
403 aa  185  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.8 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  37.26 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.21 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  34.21 
 
 
356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  34.21 
 
 
351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  35.46 
 
 
327 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 
356 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 
356 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  38.33 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 
360 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  37.92 
 
 
456 aa  179  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  37.7 
 
 
362 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 
369 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 
337 aa  173  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  36.43 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
369 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 
451 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  34.83 
 
 
464 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  36.51 
 
 
623 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  33.01 
 
 
335 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  36.08 
 
 
314 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  35.9 
 
 
389 aa  169  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  34.24 
 
 
471 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 
339 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  36.24 
 
 
467 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  39.45 
 
 
339 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  36.24 
 
 
467 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 
579 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  36.61 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  38.94 
 
 
349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  33.02 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  36.48 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  36.39 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  39.56 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 
327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  34.43 
 
 
414 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 
337 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 
407 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  38.96 
 
 
340 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 
339 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 
364 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  34.87 
 
 
336 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 
416 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 
422 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  33.05 
 
 
425 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 
334 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 
339 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 
339 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 
415 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 
418 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  36.59 
 
 
454 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 
546 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  30.43 
 
 
600 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
341 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  32.39 
 
 
343 aa  157  4e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  36.02 
 
 
339 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  36.02 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  37.2 
 
 
259 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 
385 aa  155  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  34.26 
 
 
339 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 
399 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>