More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0571 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 375 aa  736    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  45.15 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  48.06 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  43.18 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  44.75 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  43.42 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  38.63 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.23 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.02 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.87 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  45.23 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.73 
 
 		 359 aa  245  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.35 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40.52 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  44.05 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.62 
 
 		 358 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 382 aa  239  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  45.27 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  46.56 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  43.15 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 369 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  38.1 
 
 		 356 aa  230  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  39.6 
 
 		 399 aa  226  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 369 aa  225  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  44.99 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.51 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  41.53 
 
 		 374 aa  222  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 349 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  38.29 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.55 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  43.12 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  45.17 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.06 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  44.18 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  44.36 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.5 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  40.77 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  35.96 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  45.14 
 
 		 320 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 375 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  43.58 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  42.61 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  39.7 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.56 
 
 		 385 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  46.02 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  42.52 
 
 		 375 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.77 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.11 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  39.2 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  45.17 
 
 		 338 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.7 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  39.25 
 
 		 380 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  51.85 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  41.94 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.37 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.33 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  44.62 
 
 		 358 aa  202  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  51.39 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  45.76 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  37.95 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  43.21 
 
 		 337 aa  199  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  41.37 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  44.24 
 
 		 668 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  39.19 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  41.37 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.97 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  39.59 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  45.49 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  41.37 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  37.81 
 
 		 426 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  45.15 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  35.99 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  45.61 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  44.86 
 
 		 393 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  46.3 
 
 		 396 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  46.3 
 
 		 396 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  45.12 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  46.3 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  46.3 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  45.74 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  33.7 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  46.18 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>