More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3214 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.17 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.91 
 
 		 250 aa  111  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  34.67 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  36.96 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.83 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  36.22 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  39.51 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  34.54 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  38.2 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  36.9 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  30 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.2 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.84 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  35.98 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 310 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  36.65 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  38.73 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  35.88 
 
 		 250 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.26 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  38.95 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  38.15 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  36 
 
 		 239 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.91 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.91 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 253 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  37.43 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.98 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.28 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  27.57 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0192  CRP family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  32.45 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  31.28 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0749  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.887641  normal  0.079497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  27.7 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 		 403 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2061  Crp family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00300081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2279  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 211 aa  85.1  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  32.42 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3927  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.729399  hitchhiker  0.00211875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.05 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  28.87 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.8 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.19 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.5 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  25.37 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  26.74 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4644  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>