96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3934 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  45.42 
 
 
1083 aa  837    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  100 
 
 
1117 aa  2226    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  62.04 
 
 
974 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  60.81 
 
 
673 aa  315  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  57.3 
 
 
968 aa  305  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  54.29 
 
 
1189 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  51.29 
 
 
1182 aa  249  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  38.39 
 
 
709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  45.99 
 
 
847 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  45.45 
 
 
924 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  44.53 
 
 
1126 aa  207  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  27.21 
 
 
1048 aa  176  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  48.89 
 
 
833 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  23.91 
 
 
1147 aa  148  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  24.24 
 
 
1090 aa  135  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  32.19 
 
 
1043 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  25.19 
 
 
1075 aa  129  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  32.74 
 
 
1060 aa  129  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  30.9 
 
 
1063 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.28 
 
 
1021 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.72 
 
 
1041 aa  121  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  30.58 
 
 
1078 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  31 
 
 
1321 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  32.24 
 
 
1084 aa  114  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.71 
 
 
983 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.76 
 
 
1044 aa  112  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  31.44 
 
 
1054 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.73 
 
 
931 aa  108  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  30.74 
 
 
999 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.52 
 
 
1082 aa  105  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  30.77 
 
 
952 aa  99.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.14 
 
 
1060 aa  97.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  29.74 
 
 
681 aa  97.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  28.84 
 
 
1032 aa  92.4  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  28.92 
 
 
1750 aa  92.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  28.75 
 
 
1220 aa  86.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.18 
 
 
630 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  28.94 
 
 
787 aa  79.7  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  26.94 
 
 
931 aa  79  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.75 
 
 
652 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  28.37 
 
 
931 aa  78.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.48 
 
 
757 aa  78.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  61.9 
 
 
164 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.88 
 
 
608 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  29.61 
 
 
912 aa  68.6  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  31.06 
 
 
876 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  25.25 
 
 
597 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.02 
 
 
345 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.02 
 
 
345 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.52 
 
 
909 aa  61.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  28.12 
 
 
942 aa  58.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  25.97 
 
 
488 aa  56.2  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.57 
 
 
842 aa  56.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  31.45 
 
 
1191 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  31.29 
 
 
323 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  26.46 
 
 
935 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  24.09 
 
 
362 aa  55.5  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  35.11 
 
 
557 aa  55.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.03 
 
 
707 aa  54.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.49 
 
 
694 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.25 
 
 
366 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  26.92 
 
 
363 aa  53.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  22.63 
 
 
357 aa  52  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.08 
 
 
361 aa  51.6  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  40 
 
 
638 aa  51.6  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  23.28 
 
 
357 aa  51.6  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 
393 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  26.97 
 
 
357 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  22.63 
 
 
357 aa  51.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  24.73 
 
 
910 aa  50.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  26.38 
 
 
661 aa  49.7  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  22.63 
 
 
357 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  26.4 
 
 
357 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  26.97 
 
 
357 aa  48.9  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  28.12 
 
 
934 aa  48.5  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  26.97 
 
 
350 aa  48.5  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  24.07 
 
 
373 aa  47.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  29.52 
 
 
913 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  31.97 
 
 
780 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25.29 
 
 
421 aa  48.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  28.67 
 
 
362 aa  47  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  25.79 
 
 
347 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  23.78 
 
 
371 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4813  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.63 
 
 
778 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  27.41 
 
 
303 aa  46.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  21.71 
 
 
357 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  23.94 
 
 
357 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  21.71 
 
 
357 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  26.69 
 
 
836 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  30.71 
 
 
906 aa  45.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  25.95 
 
 
320 aa  45.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  24.52 
 
 
1904 aa  45.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  25.91 
 
 
873 aa  45.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  27.59 
 
 
343 aa  44.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  24.71 
 
 
357 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  24.71 
 
 
357 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>