150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2396 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  100 
 
 
328 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  42.27 
 
 
320 aa  267  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  31.87 
 
 
338 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  36.81 
 
 
337 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  34.52 
 
 
336 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 
336 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  32.67 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.81 
 
 
392 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  30.67 
 
 
361 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  30.18 
 
 
362 aa  129  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  28.83 
 
 
359 aa  126  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  28.88 
 
 
380 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  29.14 
 
 
380 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  30.13 
 
 
380 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  28.88 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  27.83 
 
 
379 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  28.81 
 
 
379 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 
379 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  28.48 
 
 
379 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  28.12 
 
 
369 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  25.7 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  27 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  27.44 
 
 
371 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  27.16 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  24.13 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  26.94 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  28.69 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  23.35 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  26.12 
 
 
500 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  29.28 
 
 
634 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  24.64 
 
 
559 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.99 
 
 
1305 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  30.73 
 
 
398 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  27.65 
 
 
449 aa  63.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  28.93 
 
 
288 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  43.53 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.02 
 
 
270 aa  56.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  28.47 
 
 
806 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  34.62 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  26.64 
 
 
453 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  24.66 
 
 
631 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  20.36 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  25.7 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  41.98 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  43.21 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 
274 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  37.21 
 
 
265 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  31.64 
 
 
790 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  22.71 
 
 
376 aa  52.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  34.21 
 
 
507 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  26.76 
 
 
763 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  28.95 
 
 
795 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  38.82 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  27.84 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 
314 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  28.06 
 
 
890 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  29.29 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  24.07 
 
 
730 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  27.08 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  26.26 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  32.84 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  33.73 
 
 
273 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  32.11 
 
 
914 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  29.01 
 
 
822 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  32.17 
 
 
725 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 
818 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  27.08 
 
 
438 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  28.36 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  27.41 
 
 
571 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  23.89 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  26.57 
 
 
645 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  26.8 
 
 
278 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  29.73 
 
 
295 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 
886 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0744  transglutaminase domain protein  25.38 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0804434  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  26.42 
 
 
279 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30 
 
 
827 aa  49.3  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 
762 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  27.07 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.73 
 
 
783 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  39.71 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  32.54 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  31.93 
 
 
525 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  24.06 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  24.66 
 
 
467 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  25.34 
 
 
681 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  34.74 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 
507 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  28.77 
 
 
436 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
677 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  24.26 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  25.67 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  35.59 
 
 
654 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.17 
 
 
744 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 
417 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  25.38 
 
 
794 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  25 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  27.91 
 
 
763 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  26.56 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1198  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 
491 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.135202  normal  0.356317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>