152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1422 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1422  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.309633  normal  0.119588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2437  cyclic nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0657  cyclic nucleotide-binding protein  33.96 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418671  normal  0.417958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0837  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.05 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2812  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  27.95 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.96 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.57 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  26.24 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  25.52 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  25 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.23 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  25.97 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  23.72 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0644  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.15 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000386152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.86 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  24.37 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.4 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5204  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.26828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2668  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.25 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0967754  hitchhiker  0.000000348595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.61 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2027  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.33 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  27.27 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  23.4 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.15 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.35 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.33 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  23.08 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  20.1 
 
 		 352 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 281 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.39 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.52 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.62 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  25.24 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.35 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.76 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  25.27 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  20.2 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.52 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  21.88 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  22.75 
 
 		 210 aa  45.4  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1307  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.385946  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.28 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1123  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  22.75 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  22.75 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.34 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  22.75 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.71 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>