67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2087 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  100 
 
 		 166 aa  338  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  64.19 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 301 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  29.71 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  28.8 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  37.41 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  32.52 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.85 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  29.8 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  26.85 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  34.25 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.01 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22660  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  40.67 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  34.59 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.47 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 264 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  29.66 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  27.33 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  31.03 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28460  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  26.79 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.23 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  28.03 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  27.91 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  29.58 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  27.07 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  29.01 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.49 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6627  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.68 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787104  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5334  transcription activator effector binding  28.26 
 
 		 255 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  26.92 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  27.46 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  29.08 
 
 		 276 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  25.19 
 
 		 268 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 297 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  27.91 
 
 		 242 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  28.28 
 
 		 241 aa  50.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  25.5 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  27.91 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20280  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  29.57 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0307549  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.78 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  26.67 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.2 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  22.92 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  31.01 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  30.15 
 
 		 276 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 273 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  22.09 
 
 		 267 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  25.2 
 
 		 132 aa  44.7  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  26.72 
 
 		 298 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4616  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.43 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 270 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0263  transcription activator, effector binding protein  28.38 
 
 		 166 aa  43.9  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  31.71 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3657  transcription activator effector binding  27.94 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.65 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 270 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  23.2 
 
 		 269 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  20.57 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  22.31 
 
 		 343 aa  41.2  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 264 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 265 aa  41.2  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  25.95 
 
 		 257 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>