More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1881 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 279 aa  554  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  72.73 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.44 
 
 		 258 aa  358  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  69.17 
 
 		 253 aa  358  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  70.68 
 
 		 257 aa  358  8e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  71.54 
 
 		 253 aa  349  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  68.24 
 
 		 255 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  69.57 
 
 		 253 aa  345  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.23 
 
 		 251 aa  341  8e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  64.2 
 
 		 257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  68.92 
 
 		 259 aa  335  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.27 
 
 		 262 aa  332  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  67.89 
 
 		 253 aa  328  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  64.57 
 
 		 253 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.87 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  64.43 
 
 		 256 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.8 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  62.06 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.26 
 
 		 259 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.87 
 
 		 253 aa  295  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  57.25 
 
 		 257 aa  291  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  58.5 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  59.13 
 
 		 255 aa  282  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  56.64 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  57.54 
 
 		 260 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.56 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  57.31 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  53.94 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  53.73 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  48.85 
 
 		 280 aa  250  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.23 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  52.94 
 
 		 263 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  49.61 
 
 		 278 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.8 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.69 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.69 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.31 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  39.84 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.8 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 		 264 aa  212  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.4 
 
 		 264 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  40.7 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 		 233 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.88 
 
 		 233 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.37 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.9 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.66 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.13 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  42.21 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.03 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.86 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.08 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.08 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.6 
 
 		 251 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  38.75 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  36.07 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  41.1 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  36.82 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.3 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  38.08 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.83 
 
 		 243 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.57 
 
 		 249 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.08 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  37.45 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  38.3 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  37.45 
 
 		 239 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.74 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  38.2 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  39.42 
 
 		 249 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  41.88 
 
 		 241 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.98 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.63 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.08 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2592  undecaprenyl diphosphate synthase  37.71 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.427666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.75 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.3 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.19 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  38.1 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.19 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  36.91 
 
 		 231 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  36.51 
 
 		 252 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  38.98 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  38.4 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.75 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>