More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0216 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 501 aa  1001    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 496 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 499 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 500 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 506 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 500 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 528 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 1113 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 512 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 		 502 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 502 aa  557  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 1100 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 504 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  56.58 
 
 		 1098 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 503 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 509 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 1094 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  54.12 
 
 		 510 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 501 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 505 aa  498  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 504 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 500 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  52.18 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 1101 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 1100 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 507 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 1112 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 1112 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 1111 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51.43 
 
 		 1147 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 1138 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 1172 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  48.77 
 
 		 565 aa  464  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 1120 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 560 aa  438  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 1118 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 494 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.81 
 
 		 771 aa  422  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 573 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 573 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 510 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 573 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 497 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 502 aa  412  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 499 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 499 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 499 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 499 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 498 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 508 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 631 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 509 aa  395  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>