More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3769 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  76.55 
 
 
226 aa  320  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  76.55 
 
 
226 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  66.53 
 
 
232 aa  291  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  47.85 
 
 
211 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  46.72 
 
 
221 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  25.11 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  30.08 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.1 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.65 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  29.59 
 
 
880 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  34.59 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.29 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.66 
 
 
821 aa  65.5  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  37.4 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.73 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.41 
 
 
152 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  28.78 
 
 
291 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.19 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 
149 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  34.35 
 
 
368 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
373 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
162 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  32.26 
 
 
164 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
410 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  29.92 
 
 
385 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  26.92 
 
 
155 aa  62  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.76 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.5 
 
 
907 aa  61.6  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.32 
 
 
909 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
141 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.14 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.25 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
385 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  33.09 
 
 
133 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  30.61 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  34.04 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  28.02 
 
 
875 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 
256 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  29.45 
 
 
330 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.08 
 
 
151 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  26.76 
 
 
155 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
120 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  22.15 
 
 
149 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  32.06 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  31.47 
 
 
423 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
150 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  28.79 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  26.38 
 
 
383 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  28.02 
 
 
875 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 
144 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34.62 
 
 
191 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 
873 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.62 
 
 
873 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  37.4 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.45 
 
 
150 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  29.13 
 
 
909 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
141 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.43 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 
148 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.06 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 
162 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  29.73 
 
 
151 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  28.47 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  25.16 
 
 
155 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.86 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 
428 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 
698 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
146 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  27.56 
 
 
845 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.06 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  32.08 
 
 
164 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  30.65 
 
 
143 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.08 
 
 
152 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  28.15 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  27.21 
 
 
141 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  31.06 
 
 
141 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.37 
 
 
208 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.58 
 
 
426 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  27.85 
 
 
390 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.91 
 
 
710 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.13 
 
 
427 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  25.97 
 
 
154 aa  55.1  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.75 
 
 
769 aa  55.1  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.46 
 
 
660 aa  55.1  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  25.58 
 
 
214 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
863 aa  55.1  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  29.86 
 
 
249 aa  55.1  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  25.58 
 
 
214 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>