More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2041 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
511 aa  973    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  62.81 
 
 
502 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2829  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  57.93 
 
 
478 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  56.42 
 
 
474 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  58.35 
 
 
477 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.42 
 
 
487 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  47.96 
 
 
508 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.62 
 
 
490 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3948  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.35 
 
 
523 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.822582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.75 
 
 
489 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  44.09 
 
 
498 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  44.4 
 
 
499 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  45.14 
 
 
490 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.78 
 
 
495 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.2 
 
 
501 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.2 
 
 
501 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.14 
 
 
523 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.84 
 
 
486 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  45.01 
 
 
497 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.24 
 
 
477 aa  346  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.41 
 
 
512 aa  346  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.31 
 
 
532 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116947  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.17 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.24 
 
 
496 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.99 
 
 
496 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.99 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  44.78 
 
 
496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.59 
 
 
515 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  0.820801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.07 
 
 
520 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.17 
 
 
495 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.55 
 
 
516 aa  333  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.97 
 
 
497 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.48 
 
 
486 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.58 
 
 
523 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 
538 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 
538 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 
538 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 
538 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 
538 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 
538 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.38 
 
 
523 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.38 
 
 
523 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 
538 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.98 
 
 
485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3082  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.74 
 
 
536 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.88 
 
 
539 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.56 
 
 
497 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.84 
 
 
514 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.84 
 
 
514 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.42 
 
 
508 aa  319  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.78 
 
 
520 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.09 
 
 
488 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.09 
 
 
488 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.3 
 
 
488 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0051  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.97 
 
 
527 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27692  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.35 
 
 
509 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.37 
 
 
501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.63 
 
 
523 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14360  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.51 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2011  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.14 
 
 
497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0256922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2205  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.7 
 
 
471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.916558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.26 
 
 
521 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  39.61 
 
 
479 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.37 
 
 
537 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.41 
 
 
500 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4418  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.25 
 
 
496 aa  300  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2417  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.68 
 
 
479 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.13 
 
 
511 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
500 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.24 
 
 
464 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.23 
 
 
509 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.847898  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.88 
 
 
492 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.72 
 
 
516 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.15 
 
 
533 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1748  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  39.78 
 
 
488 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630432  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.39 
 
 
502 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222051  normal  0.460518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.61 
 
 
493 aa  286  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.09 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.64 
 
 
499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00474819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0358  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.4 
 
 
509 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.79 
 
 
495 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.53 
 
 
478 aa  279  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.79 
 
 
471 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.36 
 
 
471 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.77 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0692116  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.74 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3362  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.7 
 
 
489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0212058  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.53 
 
 
498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.09 
 
 
482 aa  269  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4865  RND cation/multidrug efflux system outer membrane protein, NodT  42.14 
 
 
493 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000716421  normal  0.820676 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5123  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.81 
 
 
510 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.83 
 
 
517 aa  266  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
510 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1741  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.32 
 
 
514 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259166  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
510 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  40.69 
 
 
510 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
510 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  40.69 
 
 
510 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.39 
 
 
513 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>