More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0258 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  34.78 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  34.36 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  34.08 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  29.96 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  37.2 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  31.93 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  37.65 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  31.22 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  32.29 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  30.89 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  33.78 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  33.04 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  28.51 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  31.82 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  28.36 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  29.35 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  29.35 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  29.65 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.21 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  30.97 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  35.19 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.81 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  30.94 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  31.91 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27.66 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27.66 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27.66 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  26.23 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  28.07 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  31.86 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>