More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2465 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2465  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
218 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  27.98 
 
 
1421 aa  81.6  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.57 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2250  hypothetical protein  28.5 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  29.7 
 
 
1447 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.58 
 
 
233 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  27.47 
 
 
1465 aa  77.4  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  29.15 
 
 
616 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.16 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.53 
 
 
595 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.54 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  28.24 
 
 
1365 aa  72.4  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  31.66 
 
 
584 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  30.67 
 
 
1449 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1010  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.12 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0343997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  30.67 
 
 
1449 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  30.57 
 
 
570 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1265  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.84 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  31.02 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  26.63 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  28.11 
 
 
1426 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.58 
 
 
921 aa  69.7  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  26.6 
 
 
1527 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  26.37 
 
 
1402 aa  68.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  23.93 
 
 
1367 aa  68.2  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  23.93 
 
 
1367 aa  68.2  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  31.02 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  31.98 
 
 
603 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  28.81 
 
 
1390 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.88 
 
 
769 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  28.8 
 
 
578 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1305  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.37 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  25.82 
 
 
1407 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.27 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  29.69 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  30.57 
 
 
601 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.27 
 
 
719 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 
719 aa  65.1  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  31.05 
 
 
578 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.24 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  26.32 
 
 
1362 aa  64.7  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.15 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  25.7 
 
 
1433 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.06 
 
 
463 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.34 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.51 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.55 
 
 
609 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  30.3 
 
 
574 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.11 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.46 
 
 
721 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.81 
 
 
722 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  27.75 
 
 
1440 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  29.47 
 
 
584 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.57 
 
 
731 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.55 
 
 
605 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  32.8 
 
 
613 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  23.96 
 
 
707 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  28.99 
 
 
233 aa  62.4  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1867  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.64 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.675746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.44 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.47 
 
 
610 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.76 
 
 
481 aa  62  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  25.39 
 
 
1397 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  28.72 
 
 
299 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.14 
 
 
929 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  31.61 
 
 
574 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.33 
 
 
595 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0379  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.94 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.21 
 
 
695 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  28.8 
 
 
601 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5186  exonuclease  30.41 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.229542  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  30.81 
 
 
566 aa  60.1  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.03 
 
 
466 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  27.69 
 
 
695 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  23.76 
 
 
1442 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0353  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.94 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.78 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  26.21 
 
 
1433 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.72 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.42 
 
 
475 aa  58.5  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.18 
 
 
695 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  28.9 
 
 
223 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  25.73 
 
 
1433 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  25.73 
 
 
1433 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2858  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.52 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.62 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0470  exonuclease, putative  29.21 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.15 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 
476 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  26.21 
 
 
1433 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>