More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1592 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
198 aa  396  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 
195 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 
195 aa  181  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 
194 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 
195 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  49.2 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  49.2 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  49.2 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
195 aa  177  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  48.66 
 
 
195 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  48.66 
 
 
195 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  48.66 
 
 
195 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 
197 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
219 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 
242 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
211 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
254 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
254 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
254 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
254 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
254 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
254 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
254 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.32 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
248 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  30 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
324 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
335 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
242 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
215 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  27.5 
 
 
221 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
256 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 
291 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
233 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 
247 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  28.27 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 
255 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
198 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 
184 aa  61.6  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
205 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
205 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
226 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 
200 aa  61.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
209 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>