More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0259 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  98.41 
 
 		 1256 aa  2367    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  95.65 
 
 		 1256 aa  1999    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  67.38 
 
 		 1253 aa  1302    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1256 aa  2403    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  21.78 
 
 		 1225 aa  270  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  27.98 
 
 		 647 aa  146  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  26.22 
 
 		 636 aa  125  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  26.3 
 
 		 636 aa  124  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 1096 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  26.59 
 
 		 647 aa  122  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  23.67 
 
 		 667 aa  119  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  20.73 
 
 		 1257 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1239 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0249  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1238 aa  112  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0260  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1238 aa  111  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  26.74 
 
 		 621 aa  109  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  26.74 
 
 		 621 aa  109  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  24.24 
 
 		 616 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  26.09 
 
 		 659 aa  106  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  24.83 
 
 		 632 aa  106  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  24.72 
 
 		 639 aa  105  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  22.84 
 
 		 673 aa  103  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  25.29 
 
 		 637 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  25.29 
 
 		 637 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  23.08 
 
 		 753 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  23.97 
 
 		 647 aa  101  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  23.97 
 
 		 647 aa  101  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  29.17 
 
 		 342 aa  98.6  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0259  hypothetical protein  31.14 
 
 		 403 aa  98.2  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1028 aa  96.3  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  24.44 
 
 		 637 aa  94  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  28.34 
 
 		 641 aa  91.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  23.02 
 
 		 840 aa  90.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  24.42 
 
 		 633 aa  90.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  23.12 
 
 		 632 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1433 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  27.81 
 
 		 638 aa  88.2  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  27.81 
 
 		 638 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  23.14 
 
 		 633 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  26.56 
 
 		 634 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  26.26 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  29.55 
 
 		 1431 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  26.22 
 
 		 634 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1433 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  20.96 
 
 		 637 aa  83.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  22.24 
 
 		 613 aa  80.9  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  22.24 
 
 		 613 aa  80.9  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 878 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  25 
 
 		 1241 aa  80.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.36 
 
 		 587 aa  79.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  23.16 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.97 
 
 		 545 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.02 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 		 856 aa  79  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.75 
 
 		 725 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  29.97 
 
 		 632 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  29.97 
 
 		 626 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.23 
 
 		 816 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  23.1 
 
 		 664 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  20.77 
 
 		 898 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  29.97 
 
 		 629 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 3145 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  27.51 
 
 		 658 aa  73.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  29.97 
 
 		 626 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  20.06 
 
 		 621 aa  73.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  23.15 
 
 		 636 aa  73.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  29.97 
 
 		 626 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  29.97 
 
 		 634 aa  73.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 909 aa  72.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  29.97 
 
 		 588 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.43 
 
 		 545 aa  72.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 685 aa  72  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1338 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 665 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  23.67 
 
 		 672 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 565 aa  68.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  23.9 
 
 		 678 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  27.62 
 
 		 672 aa  67.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  38.28 
 
 		 2262 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  26.74 
 
 		 643 aa  66.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  21.1 
 
 		 865 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.98 
 
 		 564 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 4079 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  26.67 
 
 		 684 aa  64.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  22.22 
 
 		 603 aa  63.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1042 aa  63.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 		 1737 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  39.13 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 		 2262 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 808 aa  62  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 597 aa  62  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  38.1 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  20.6 
 
 		 750 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 827 aa  61.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>