More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2345 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  100 
 
 
1064 aa  2235    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  70.6 
 
 
803 aa  658    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  32.68 
 
 
680 aa  346  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  34.2 
 
 
638 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  32.8 
 
 
669 aa  340  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  30.59 
 
 
946 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.95 
 
 
664 aa  334  7.000000000000001e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  32.37 
 
 
652 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  32.37 
 
 
652 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  32.37 
 
 
671 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  31.94 
 
 
656 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  31.55 
 
 
941 aa  327  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  39.63 
 
 
626 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  29.09 
 
 
606 aa  282  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  41.43 
 
 
627 aa  281  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  42.62 
 
 
561 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  36.97 
 
 
581 aa  266  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  35.78 
 
 
621 aa  266  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  38.01 
 
 
594 aa  264  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  37.41 
 
 
605 aa  262  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  40.66 
 
 
606 aa  262  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  42.51 
 
 
630 aa  261  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  35.96 
 
 
607 aa  260  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  37.07 
 
 
598 aa  259  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  37.59 
 
 
664 aa  259  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  35.1 
 
 
605 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  38.38 
 
 
580 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  42.26 
 
 
640 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  37.53 
 
 
666 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  38.26 
 
 
604 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  41.61 
 
 
672 aa  254  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  36.08 
 
 
614 aa  254  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  36.15 
 
 
619 aa  254  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  41.61 
 
 
642 aa  254  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  42.3 
 
 
604 aa  253  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  35.62 
 
 
673 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  42.26 
 
 
605 aa  252  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  44.08 
 
 
659 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  41.28 
 
 
633 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  42.62 
 
 
631 aa  252  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  42.62 
 
 
631 aa  252  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  39.54 
 
 
657 aa  252  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  38.04 
 
 
566 aa  250  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  42.62 
 
 
612 aa  250  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  36.52 
 
 
601 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  36.52 
 
 
601 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  36 
 
 
592 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  37.9 
 
 
574 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  37.86 
 
 
572 aa  244  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  39.44 
 
 
605 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  36.07 
 
 
568 aa  242  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  42.31 
 
 
564 aa  242  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  38.66 
 
 
579 aa  241  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  42.35 
 
 
621 aa  241  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  38.92 
 
 
637 aa  240  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  33.64 
 
 
589 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  36.21 
 
 
568 aa  237  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  35.39 
 
 
568 aa  236  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  37.37 
 
 
606 aa  233  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  39.58 
 
 
600 aa  232  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  36.83 
 
 
606 aa  228  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  38.17 
 
 
602 aa  225  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  36.62 
 
 
563 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  34.07 
 
 
611 aa  220  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  38.51 
 
 
593 aa  220  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  40.65 
 
 
630 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  38.05 
 
 
561 aa  218  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  36.71 
 
 
584 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  35.11 
 
 
569 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  34.72 
 
 
599 aa  212  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  34.72 
 
 
590 aa  211  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  34.81 
 
 
556 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  38.64 
 
 
594 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  31.28 
 
 
809 aa  202  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  33.02 
 
 
604 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  37.58 
 
 
746 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  38.33 
 
 
871 aa  194  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  34.53 
 
 
705 aa  180  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  30.19 
 
 
521 aa  156  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  31.91 
 
 
521 aa  154  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  30.97 
 
 
506 aa  141  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  32.3 
 
 
624 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  29.57 
 
 
551 aa  139  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  31.35 
 
 
536 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  28.12 
 
 
477 aa  136  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  29.94 
 
 
489 aa  135  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.83 
 
 
504 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.48 
 
 
521 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.71 
 
 
565 aa  131  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.77 
 
 
478 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 
640 aa  131  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  28.16 
 
 
518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  28.16 
 
 
518 aa  129  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  30.6 
 
 
457 aa  129  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  32.23 
 
 
551 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  32.23 
 
 
551 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28.53 
 
 
498 aa  127  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  30.77 
 
 
497 aa  127  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  30.71 
 
 
630 aa  127  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  31 
 
 
508 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>