More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0047 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  52.92 
 
 
262 aa  246  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  51.65 
 
 
264 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  52.92 
 
 
266 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 
259 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 
280 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  50.42 
 
 
262 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 
260 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  49.58 
 
 
282 aa  228  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  52.08 
 
 
316 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
301 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 
266 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 
278 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  47.54 
 
 
288 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.15 
 
 
266 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
266 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  48.55 
 
 
258 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
266 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
266 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
266 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
266 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
266 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  47.52 
 
 
267 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
289 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  47.5 
 
 
266 aa  214  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  47.88 
 
 
282 aa  211  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  44.26 
 
 
265 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  47.92 
 
 
274 aa  211  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  51.48 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  46.5 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  46.84 
 
 
269 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  46.89 
 
 
262 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  47.46 
 
 
305 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 
274 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  45.87 
 
 
266 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  43.85 
 
 
264 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
271 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  46.19 
 
 
315 aa  201  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  46.58 
 
 
294 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.75 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  44.96 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  42.8 
 
 
259 aa  197  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  43.21 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  47.75 
 
 
267 aa  191  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  40.98 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.84 
 
 
258 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
267 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
285 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.51 
 
 
247 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  40.98 
 
 
257 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  42.92 
 
 
271 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  41.84 
 
 
260 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  43.36 
 
 
265 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  42.5 
 
 
271 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  44.54 
 
 
260 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  43.04 
 
 
261 aa  185  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  42.04 
 
 
259 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  41.6 
 
 
256 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  43.1 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.98 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  42.5 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  40.5 
 
 
313 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  40.24 
 
 
255 aa  181  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  39.52 
 
 
257 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
266 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  41.8 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  43.28 
 
 
284 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  43.1 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  40.59 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
283 aa  178  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41.25 
 
 
266 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 
274 aa  178  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
275 aa  178  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  38.75 
 
 
260 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  41.49 
 
 
264 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
260 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  40.57 
 
 
247 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
276 aa  175  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  42.8 
 
 
273 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  40.83 
 
 
257 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
265 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  40.83 
 
 
266 aa  175  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  42.13 
 
 
265 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  40.32 
 
 
243 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  42.55 
 
 
240 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40.76 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  37.92 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  38.66 
 
 
294 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  41.6 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  40.5 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.18 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.5 
 
 
273 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  38.33 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  37.34 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.44 
 
 
496 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>