151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2109 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  100 
 
 
1276 aa  2560  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  2.03571e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  48.68 
 
 
1141 aa  276  1e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  31.88 
 
 
554 aa  214  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  35.02 
 
 
1086 aa  205  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  33.12 
 
 
564 aa  190  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  31.69 
 
 
873 aa  175  4e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  30.26 
 
 
562 aa  174  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  30.94 
 
 
605 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  30.68 
 
 
448 aa  150  2e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.11 
 
 
662 aa  149  4e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  29.19 
 
 
326 aa  141  8e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  29.33 
 
 
803 aa  139  3e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  30.48 
 
 
801 aa  135  7e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  29.15 
 
 
602 aa  134  1e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  29.86 
 
 
604 aa  134  1e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  28.15 
 
 
614 aa  134  1e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  32.11 
 
 
442 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  32.11 
 
 
442 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  32.11 
 
 
442 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  32.11 
 
 
442 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  32.11 
 
 
442 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  32.11 
 
 
442 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  32.11 
 
 
442 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  32.64 
 
 
891 aa  129  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  32.65 
 
 
534 aa  126  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  31.23 
 
 
450 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  31.23 
 
 
450 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  31.23 
 
 
450 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  28.86 
 
 
447 aa  121  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  29.14 
 
 
453 aa  120  2e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.65 
 
 
596 aa  120  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  28.88 
 
 
450 aa  116  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  25 
 
 
584 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.37555e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  27.73 
 
 
408 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  26.17 
 
 
489 aa  106  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  27.45 
 
 
446 aa  103  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.26 
 
 
1343 aa  99  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.54 
 
 
436 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  27.69 
 
 
597 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  27.69 
 
 
596 aa  96.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  30.19 
 
 
544 aa  96.3  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  24.48 
 
 
444 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  26.05 
 
 
425 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  24.74 
 
 
1025 aa  93.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  25.19 
 
 
550 aa  91.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  23.9 
 
 
457 aa  91.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  27.38 
 
 
434 aa  91.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  26.35 
 
 
415 aa  88.6  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.96 
 
 
340 aa  87.4  2e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 
437 aa  85.9  4e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  27.83 
 
 
392 aa  85.5  7e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  25.54 
 
 
444 aa  85.1  9e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  26.55 
 
 
601 aa  84.3  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  26.27 
 
 
601 aa  82.8  4e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  24.14 
 
 
654 aa  82.4  5e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  25.43 
 
 
600 aa  82.4  6e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  28.17 
 
 
482 aa  82  7e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  24.45 
 
 
460 aa  81.6  1e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  25.77 
 
 
481 aa  80.5  2e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  25.74 
 
 
550 aa  79.7  3e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  22.64 
 
 
437 aa  79.7  3e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  25.79 
 
 
476 aa  79.3  4e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  27.09 
 
 
500 aa  79.3  4e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.9 
 
 
586 aa  79.3  4e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  25.07 
 
 
450 aa  78.6  6e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  24.64 
 
 
461 aa  77.4  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  24.68 
 
 
442 aa  76.3  4e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1027  hypothetical protein  26.24 
 
 
464 aa  75.9  5e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  29.72 
 
 
380 aa  75.5  6e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  23.58 
 
 
442 aa  74.7  1e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  6.48928e-12 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.78 
 
 
398 aa  73.6  3e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  25.53 
 
 
508 aa  73.6  3e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  26.37 
 
 
743 aa  73.2  3e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  25.39 
 
 
760 aa  72.8  4e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  31.74 
 
 
417 aa  72.8  4e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
437 aa  72.8  4e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  26.2 
 
 
432 aa  70.1  2e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.46 
 
 
1495 aa  66.2  4e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1091  hypothetical protein  26.44 
 
 
472 aa  65.5  6e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0374  Carbohydrate-binding family 9  29.53 
 
 
253 aa  65.1  8e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
684 aa  65.1  9e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  26.5 
 
 
1071 aa  63.9  2e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  27.59 
 
 
325 aa  63.2  3e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 
685 aa  62  7e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21125e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  31.29 
 
 
372 aa  61.6  8e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4541e-05 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  30 
 
 
1275 aa  60.8  1e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  23.57 
 
 
763 aa  61.2  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  60.8  2e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  25.23 
 
 
772 aa  60.8  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4248  hypothetical protein  27.54 
 
 
333 aa  60.1  3e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0450926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  23.08 
 
 
426 aa  59.3  5e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  28.69 
 
 
1585 aa  58.5  7e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  29.49 
 
 
379 aa  58.5  8e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.28 
 
 
1002 aa  58.5  9e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  25 
 
 
1193 aa  58.5  9e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  28.94 
 
 
1247 aa  57.8  1e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  28.65 
 
 
1748 aa  57.8  1e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  28.69 
 
 
1474 aa  57.8  1e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  32.65 
 
 
1223 aa  57.8  1e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  28.69 
 
 
1217 aa  57.8  1e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>