More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0679 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.21 
 
 
757 aa  776    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  64.42 
 
 
852 aa  866    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  48.43 
 
 
814 aa  667    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  58.18 
 
 
805 aa  748    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.91 
 
 
743 aa  833    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  57.32 
 
 
742 aa  832    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.32 
 
 
801 aa  742    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.28 
 
 
742 aa  821    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.92 
 
 
709 aa  764    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  63.81 
 
 
769 aa  930    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.08 
 
 
806 aa  774    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  63.05 
 
 
759 aa  939    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.51 
 
 
701 aa  791    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  67.39 
 
 
736 aa  983    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  47.13 
 
 
810 aa  668    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.94 
 
 
740 aa  832    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.81 
 
 
704 aa  752    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  54.05 
 
 
713 aa  760    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.06 
 
 
757 aa  790    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  64.39 
 
 
731 aa  904    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  48.43 
 
 
806 aa  665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  58.87 
 
 
754 aa  855    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  57.3 
 
 
763 aa  816    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  54.84 
 
 
775 aa  801    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  57.3 
 
 
764 aa  821    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.89 
 
 
755 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.15 
 
 
715 aa  768    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  47.68 
 
 
829 aa  676    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  50.2 
 
 
804 aa  696    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  64.49 
 
 
731 aa  907    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  62.14 
 
 
735 aa  873    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  56.15 
 
 
718 aa  763    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  66.85 
 
 
737 aa  946    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  61.74 
 
 
768 aa  927    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.81 
 
 
730 aa  709    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  57.24 
 
 
754 aa  808    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.97 
 
 
772 aa  765    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.3 
 
 
801 aa  679    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.32 
 
 
753 aa  803    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.53 
 
 
804 aa  742    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.29 
 
 
754 aa  788    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  57.39 
 
 
754 aa  808    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.09 
 
 
736 aa  771    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.57 
 
 
738 aa  808    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.33 
 
 
757 aa  780    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.18 
 
 
781 aa  798    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  57.81 
 
 
722 aa  809    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  61.55 
 
 
723 aa  881    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  53.02 
 
 
721 aa  762    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  62.63 
 
 
760 aa  936    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.7 
 
 
773 aa  739    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.19 
 
 
763 aa  736    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.63 
 
 
740 aa  827    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.32 
 
 
784 aa  808    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.8 
 
 
808 aa  781    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  58.06 
 
 
805 aa  746    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  59.25 
 
 
810 aa  731    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  60.3 
 
 
739 aa  871    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  62.17 
 
 
719 aa  872    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  58.98 
 
 
721 aa  848    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  58.48 
 
 
756 aa  841    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.41 
 
 
754 aa  815    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.21 
 
 
800 aa  751    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  64.26 
 
 
731 aa  911    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  71.61 
 
 
732 aa  1019    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  100 
 
 
718 aa  1426    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  68.02 
 
 
738 aa  956    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  65.23 
 
 
731 aa  909    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  63.38 
 
 
727 aa  899    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  53.71 
 
 
732 aa  724    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  62.47 
 
 
738 aa  899    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  54.44 
 
 
810 aa  771    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.19 
 
 
781 aa  807    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  67.52 
 
 
737 aa  966    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  52.3 
 
 
826 aa  677    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  48.4 
 
 
739 aa  630  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  49.78 
 
 
703 aa  624  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  45.98 
 
 
703 aa  612  9.999999999999999e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  48.67 
 
 
746 aa  615  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  48.33 
 
 
699 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  44.39 
 
 
930 aa  598  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  51.74 
 
 
639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  56.63 
 
 
613 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  54.33 
 
 
647 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  57.66 
 
 
601 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  51.73 
 
 
550 aa  552  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  50.64 
 
 
788 aa  550  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  48.44 
 
 
685 aa  551  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  54.87 
 
 
776 aa  543  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  48.3 
 
 
691 aa  528  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  47.45 
 
 
803 aa  523  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  48.68 
 
 
567 aa  507  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  46.05 
 
 
729 aa  491  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  42.74 
 
 
832 aa  489  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  42.09 
 
 
756 aa  475  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  38.39 
 
 
748 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  36.18 
 
 
749 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  37.06 
 
 
750 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  35.99 
 
 
747 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  40.86 
 
 
607 aa  424  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>