More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2825 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 476 aa  908    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  51.51 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  50.82 
 
 		 421 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.72 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  50.41 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  51.6 
 
 		 424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  51.39 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  48.16 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  50.68 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.86 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.27 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3255  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.88 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  29.84 
 
 		 417 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.61 
 
 		 404 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  30.63 
 
 		 424 aa  126  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.43 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.07 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 383 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.25 
 
 		 430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.65 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  33.57 
 
 		 329 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  36.23 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  29.43 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  29.33 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  29.86 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  26.46 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  26.46 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  31.29 
 
 		 380 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  26.46 
 
 		 370 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.1 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.48 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  30.49 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  29.76 
 
 		 253 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.47 
 
 		 607 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.93 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.21 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.71 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 368 aa  103  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  24.6 
 
 		 456 aa  103  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.89 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.35 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  40.8 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.22 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  27.02 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 385 aa  101  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  27.02 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  25.21 
 
 		 364 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  27.02 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  27.02 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  27.02 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  27.02 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  25.21 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 369 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.58 
 
 		 380 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  31.32 
 
 		 409 aa  99.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  26.04 
 
 		 423 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  30.62 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  27.02 
 
 		 371 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 419 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 444 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 390 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  27.48 
 
 		 348 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  32.79 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.74 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  29.11 
 
 		 371 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  24.6 
 
 		 455 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 		 354 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  26.99 
 
 		 360 aa  97.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  35.67 
 
 		 504 aa  97.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>