More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3255 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3255  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 410 aa  719    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  38.07 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.66 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  40.06 
 
 		 414 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  47.38 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.18 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  35.4 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.54 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  36.62 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  35.23 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  34.63 
 
 		 430 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.66 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  31.33 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.44 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  30.75 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 360 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  30.31 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 		 504 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  27.6 
 
 		 424 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 405 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 435 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.46 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 489 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.16 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  30.17 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 		 368 aa  94  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  32.14 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.16 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.02 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  29.34 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.09 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  23.29 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.85 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  27.35 
 
 		 449 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  29.75 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 		 361 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  30.72 
 
 		 348 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30.48 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  27.16 
 
 		 429 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  34.34 
 
 		 395 aa  90.1  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 335 aa  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 404 aa  89.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  32.01 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  22.54 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  29.34 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.94 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  25.48 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  22.72 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.98 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  31.68 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  26.06 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  30.51 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  26.81 
 
 		 364 aa  86.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 430 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 462 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 348 aa  86.3  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  24.7 
 
 		 359 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  25.39 
 
 		 517 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  29.16 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  32.52 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  30.25 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  28.04 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  30.03 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  32.99 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>