More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1815 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
388 aa  742  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  45.89 
 
 
340 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  48.26 
 
 
418 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  45.29 
 
 
467 aa  254  2e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  41.96 
 
 
415 aa  252  8e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  42.98 
 
 
434 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  43.67 
 
 
360 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  38.72 
 
 
365 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  37.93 
 
 
390 aa  215  1e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  32.89 
 
 
349 aa  202  1e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  37.94 
 
 
366 aa  201  2e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  35.74 
 
 
380 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  36.34 
 
 
361 aa  190  3e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.78 
 
 
362 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 
392 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 
380 aa  185  1e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.79 
 
 
368 aa  185  1e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  34.42 
 
 
382 aa  185  1e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.24 
 
 
363 aa  184  2e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  1.5248e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.24 
 
 
363 aa  184  2e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  38.19 
 
 
381 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 
354 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 
361 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 
372 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  39.93 
 
 
374 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  35.67 
 
 
376 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.77 
 
 
351 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 
360 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  32.67 
 
 
372 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 
360 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  7.07575e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.32 
 
 
360 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.36323e-06  hitchhiker  1.1193e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 
360 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  35.58 
 
 
382 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  35.28 
 
 
406 aa  175  1e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  32.66 
 
 
368 aa  174  2e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.55433e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  35.41 
 
 
358 aa  174  2e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.1 
 
 
355 aa  174  2e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.86 
 
 
360 aa  174  3e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  30.35 
 
 
368 aa  174  3e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.86 
 
 
360 aa  174  3e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.38 
 
 
368 aa  173  4e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 
351 aa  173  4e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  35.55 
 
 
381 aa  172  7e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  31.82 
 
 
351 aa  172  8e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  30.48 
 
 
372 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  36.88 
 
 
376 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  39.46 
 
 
365 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.06 
 
 
375 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  32.55 
 
 
372 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  31.41 
 
 
372 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  33.74 
 
 
382 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  37.37 
 
 
353 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  34.33 
 
 
376 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 
362 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  31.65 
 
 
367 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  34.52 
 
 
372 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  37.88 
 
 
370 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 
360 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  1.41161e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 
360 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 
360 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.42821e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  30.87 
 
 
348 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  34.18 
 
 
373 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  31.31 
 
 
368 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 
360 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  30.16 
 
 
352 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  35.43 
 
 
376 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.08 
 
 
357 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  34.62 
 
 
372 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.37 
 
 
367 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
365 aa  166  7e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
365 aa  166  7e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.76 
 
 
365 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  33.02 
 
 
371 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 
365 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
365 aa  166  1e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
365 aa  166  1e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
365 aa  166  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  34.69 
 
 
366 aa  165  1e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  3.31728e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
365 aa  166  1e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  32.52 
 
 
371 aa  165  1e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
365 aa  166  1e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  33.11 
 
 
361 aa  164  2e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  2.48395e-06  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  33.33 
 
 
360 aa  164  2e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  37.37 
 
 
377 aa  165  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  35.05 
 
 
354 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
365 aa  163  5e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 
390 aa  163  5e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  32.25 
 
 
417 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  31.97 
 
 
397 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.56 
 
 
397 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 
366 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  30.19 
 
 
373 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  30.65 
 
 
357 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  30.79 
 
 
360 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.90652e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  29.14 
 
 
375 aa  159  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.65 
 
 
374 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  35.79 
 
 
365 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  30 
 
 
372 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  32.67 
 
 
397 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  32.78 
 
 
403 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>