More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1234 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 644 aa  1333    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  65.43 
 
 		 646 aa  885    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  62.2 
 
 		 662 aa  862    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  68.11 
 
 		 644 aa  929    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  67.49 
 
 		 647 aa  919    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  58 
 
 		 652 aa  761    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  49.85 
 
 		 653 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  58.39 
 
 		 644 aa  804    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  57.23 
 
 		 650 aa  739    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  49.85 
 
 		 653 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  30.9 
 
 		 693 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  31.46 
 
 		 726 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  31.46 
 
 		 726 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  31.55 
 
 		 726 aa  293  6e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  29.4 
 
 		 704 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  31.53 
 
 		 567 aa  229  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  31.46 
 
 		 422 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  30.56 
 
 		 377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  42.34 
 
 		 154 aa  98.2  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  28.46 
 
 		 930 aa  74.7  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  24.27 
 
 		 896 aa  73.9  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  23.85 
 
 		 896 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  26.35 
 
 		 361 aa  73.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  26.21 
 
 		 924 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  37 
 
 		 939 aa  69.3  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  23.53 
 
 		 1024 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  24.69 
 
 		 866 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 951 aa  68.9  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  26 
 
 		 938 aa  68.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  27.92 
 
 		 953 aa  67.8  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  24.44 
 
 		 866 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  26.59 
 
 		 913 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  26.19 
 
 		 917 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  27.42 
 
 		 925 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  26.29 
 
 		 915 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  27.87 
 
 		 906 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  26.15 
 
 		 915 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  33.57 
 
 		 963 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  25.06 
 
 		 891 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  28.98 
 
 		 912 aa  65.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1873  DNA-directed DNA polymerase  25.75 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000393429  normal  0.0429969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  23.99 
 
 		 1047 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  22.92 
 
 		 1016 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  22.89 
 
 		 866 aa  64.3  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 935 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  32.39 
 
 		 929 aa  64.3  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  24.12 
 
 		 911 aa  64.3  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  24.94 
 
 		 883 aa  64.3  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  27.05 
 
 		 931 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  26.24 
 
 		 905 aa  63.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  25.34 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  26.15 
 
 		 929 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  25.9 
 
 		 915 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 915 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  26.69 
 
 		 886 aa  62.4  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  27.64 
 
 		 917 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  25.91 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  27.64 
 
 		 917 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  35.87 
 
 		 916 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  21.94 
 
 		 912 aa  62  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 891 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 891 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 877 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 877 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  25.58 
 
 		 1060 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  24.8 
 
 		 873 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  28.12 
 
 		 932 aa  61.6  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 891 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  28.46 
 
 		 913 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  25.07 
 
 		 878 aa  62  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  24.09 
 
 		 1047 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  24.32 
 
 		 932 aa  61.6  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  24.32 
 
 		 932 aa  61.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 929 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  31.15 
 
 		 935 aa  61.6  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  24.32 
 
 		 932 aa  61.6  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  24.09 
 
 		 1047 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  24.58 
 
 		 903 aa  61.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  26.19 
 
 		 895 aa  61.2  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  26.42 
 
 		 899 aa  61.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 908 aa  61.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  22.92 
 
 		 877 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  25.21 
 
 		 956 aa  60.8  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  27.38 
 
 		 910 aa  60.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  28.05 
 
 		 913 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  22.88 
 
 		 877 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  27.24 
 
 		 915 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  27.24 
 
 		 917 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 877 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  23.85 
 
 		 930 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  25.3 
 
 		 985 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  27.24 
 
 		 917 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  27.24 
 
 		 917 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  26.51 
 
 		 1013 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  27.24 
 
 		 917 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 877 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>