More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4395 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
203 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  47.49 
 
 
186 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 
205 aa  131  7e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 
213 aa  84  1e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 
194 aa  83.6  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
228 aa  82  5e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 
220 aa  81.3  9e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
200 aa  79.3  3e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
200 aa  79  5e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 
196 aa  76.3  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
203 aa  73.6  2e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
191 aa  73.9  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
194 aa  70.1  2e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
239 aa  68.9  4e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
187 aa  68.6  6e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  34.38 
 
 
216 aa  68.6  7e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
235 aa  67.8  1e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
218 aa  67.4  1e-10  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
218 aa  67  2e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
186 aa  66.2  3e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 
193 aa  65.5  5e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 
209 aa  65.1  7e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
217 aa  64.7  8e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
212 aa  64.7  8e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  33.12 
 
 
207 aa  64.3  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  32.76 
 
 
215 aa  64.3  1e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
200 aa  64.3  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
263 aa  64.3  1e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 
213 aa  63.2  2e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
206 aa  62.8  3e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
193 aa  63.2  3e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
258 aa  62.8  3e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
198 aa  62.8  4e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  31.76 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
205 aa  60.5  2e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
222 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 
217 aa  59.7  3e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 
244 aa  59.3  3e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
233 aa  59.7  3e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  3.23068e-05 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
197 aa  59.3  4e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 
189 aa  58.9  5e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
211 aa  58.5  6e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
211 aa  58.5  7e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  45.61 
 
 
208 aa  58.5  7e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
211 aa  58.5  7e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
202 aa  58.2  8e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
228 aa  58.2  8e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
290 aa  58.2  9e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
211 aa  58.2  9e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
273 aa  57.4  1e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
273 aa  57.4  1e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
273 aa  57.4  1e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
212 aa  57.8  1e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
201 aa  57.4  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
213 aa  57.4  1e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
201 aa  57.4  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
211 aa  57.4  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
211 aa  57.8  1e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
215 aa  57.8  1e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57  2e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  50 
 
 
227 aa  57  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  54.84 
 
 
231 aa  56.6  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
212 aa  57  2e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57  2e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
272 aa  57  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
212 aa  57  2e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
212 aa  57  2e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
201 aa  57.4  2e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.94535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
273 aa  57  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  53.85 
 
 
340 aa  57  2e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
201 aa  57.4  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
239 aa  57  2e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
212 aa  57  2e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
317 aa  56.6  3e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
318 aa  56.6  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
318 aa  56.6  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
318 aa  56.6  3e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
276 aa  56.2  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
207 aa  56.2  3e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
316 aa  56.6  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
318 aa  56.6  3e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
316 aa  56.6  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  49.12 
 
 
213 aa  56.2  3e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
272 aa  56.2  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
316 aa  56.6  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  49.12 
 
 
214 aa  56.2  3e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  9.3152e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
225 aa  55.8  4e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
198 aa  55.8  4e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
204 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
204 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
201 aa  56.2  4e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  3.10562e-15 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 
231 aa  55.8  4e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
208 aa  55.5  5e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 
352 aa  55.5  5e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
220 aa  55.5  5e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  50.77 
 
 
239 aa  55.5  5e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  44.07 
 
 
210 aa  55.5  5e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  44.07 
 
 
210 aa  55.5  5e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 
218 aa  55.5  5e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>