More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1778 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  45.4 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 211 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  39.51 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  34.39 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  40.61 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  35.6 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  35.8 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 197 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  41.04 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  35.23 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  55.88 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  46.15 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  33.96 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 332 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.71 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  41.43 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>