75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1291 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1054    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  29.32 
 
 		 963 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27 
 
 		 1130 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  31.11 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1030 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  29.47 
 
 		 1026 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1750 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 772 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.51 
 
 		 1292 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.7 
 
 		 2296 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  30.61 
 
 		 646 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 850 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 		 892 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1051 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 		 652 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1351 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  33.49 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.3 
 
 		 493 aa  86.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 863 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  26.81 
 
 		 1046 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1763 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  35 
 
 		 2831 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  41.84 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.1 
 
 		 693 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  26.43 
 
 		 623 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  37.93 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.19 
 
 		 841 aa  64.3  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  24.49 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  31.9 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  25.08 
 
 		 581 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  24.21 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  23.62 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  28.87 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  22.91 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  33.62 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.69 
 
 		 831 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  23.46 
 
 		 756 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.28 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  26.18 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  30.18 
 
 		 1675 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  22.67 
 
 		 634 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  25.86 
 
 		 498 aa  55.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.12 
 
 		 930 aa  54.3  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 719 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.86 
 
 		 2350 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 		 732 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  30.63 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.07 
 
 		 628 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.05 
 
 		 639 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 2961 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.17 
 
 		 612 aa  50.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  22.43 
 
 		 676 aa  50.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.56 
 
 		 612 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  23.14 
 
 		 770 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26.84 
 
 		 391 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  35.42 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  36.26 
 
 		 1140 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  23.68 
 
 		 1293 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  22.88 
 
 		 387 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  24.23 
 
 		 805 aa  47.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  22.81 
 
 		 448 aa  47  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.64 
 
 		 930 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  23.16 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  29.41 
 
 		 697 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  21.95 
 
 		 752 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1030 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  32.24 
 
 		 694 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  23.23 
 
 		 699 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.57 
 
 		 612 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  29.09 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  24.47 
 
 		 668 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25 
 
 		 588 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  21.85 
 
 		 470 aa  43.9  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.36 
 
 		 579 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>