More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1972 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  55.7 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  53.46 
 
 		 266 aa  279  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  50.74 
 
 		 270 aa  278  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  52.42 
 
 		 269 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  50.37 
 
 		 270 aa  277  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  49.24 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0163  TPR repeat-containing protein  46.06 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0119  hypothetical protein  46.56 
 
 		 254 aa  204  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000942476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01941  Tfp pilus assembly protein PilF  47.23 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  44.31 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1707  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  39.13 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18241  hypothetical protein  40.77 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.219981  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18031  hypothetical protein  38.43 
 
 		 262 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  38.08 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35856  predicted protein  35.5 
 
 		 344 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142385  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.66 
 
 		 810 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 878 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 847 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 611 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.54 
 
 		 626 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 614 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 635 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 635 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36370  predicted protein  37.89 
 
 		 213 aa  105  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.08989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 614 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.29 
 
 		 1056 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.06 
 
 		 626 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.12 
 
 		 1056 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.06 
 
 		 614 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 614 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.06 
 
 		 614 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 637 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.52 
 
 		 626 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.09 
 
 		 1022 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 632 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 612 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 639 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 636 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.77 
 
 		 988 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 649 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 		 406 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 		 406 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.61 
 
 		 784 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39123  predicted protein  35.16 
 
 		 196 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.71 
 
 		 818 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 392 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 352 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.37 
 
 		 620 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 620 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.1 
 
 		 542 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 3035 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 615 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  33.15 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.95 
 
 		 706 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 4489 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 280 aa  88.6  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 515 aa  88.6  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.43 
 
 		 582 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  31.76 
 
 		 462 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.89 
 
 		 706 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  30.87 
 
 		 539 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.29 
 
 		 622 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 617 aa  85.9  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  38.53 
 
 		 547 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 602 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1421 aa  85.5  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 3145 aa  85.1  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 1276 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 3560 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 750 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 681 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 909 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 1737 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 556 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 732 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 718 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.51 
 
 		 816 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.65 
 
 		 725 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 687 aa  82.4  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.74 
 
 		 820 aa  82.4  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 1061 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1827 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 1038 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.32 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.97 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 637 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.53 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>