More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  53.18 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  53.81 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  48.15 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  31.31 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.37 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  36.76 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  30.41 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  38.41 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>