More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4322 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  99.56 
 
 
225 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 
225 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  83.11 
 
 
225 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  70.98 
 
 
224 aa  328  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  74.55 
 
 
224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  74.11 
 
 
224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  72.77 
 
 
224 aa  323  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  72.77 
 
 
224 aa  322  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  72.32 
 
 
224 aa  321  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.88 
 
 
224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  72.32 
 
 
224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.88 
 
 
224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.88 
 
 
224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  71.88 
 
 
224 aa  318  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  72.77 
 
 
224 aa  315  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  61.88 
 
 
226 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.33 
 
 
226 aa  279  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.46 
 
 
228 aa  270  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  59.19 
 
 
228 aa  270  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.47 
 
 
220 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.85 
 
 
225 aa  267  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  60.71 
 
 
225 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  60.27 
 
 
224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.04 
 
 
228 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  62.95 
 
 
225 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.76 
 
 
225 aa  258  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.38 
 
 
224 aa  257  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  56.76 
 
 
225 aa  256  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.31 
 
 
225 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.01 
 
 
242 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  57.52 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  56.05 
 
 
226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.16 
 
 
226 aa  251  9.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  55.11 
 
 
225 aa  250  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  62.45 
 
 
246 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.33 
 
 
225 aa  242  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.14 
 
 
241 aa  238  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  46.4 
 
 
236 aa  206  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  45.13 
 
 
239 aa  203  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
230 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
230 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  34.26 
 
 
243 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
246 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
263 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.14 
 
 
228 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
225 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.21 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
227 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.87 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.87 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.11 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
226 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 
226 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 
236 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  37.07 
 
 
214 aa  121  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.34 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.81 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.37 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  34.8 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.15 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
217 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 
224 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  30.18 
 
 
229 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
228 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.89 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.89 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 
222 aa  111  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.09 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.57 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
234 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
226 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
250 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
228 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.32 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.29 
 
 
237 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
222 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
235 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
234 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
236 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.46 
 
 
222 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 
234 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.99 
 
 
224 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
228 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.57 
 
 
228 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 
236 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
237 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.68 
 
 
227 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>