More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3088 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 342 aa  675    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  92.19 
 
 		 317 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  66.78 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  52.94 
 
 		 326 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  53.77 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  55.74 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  56.46 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  51.41 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  55.86 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  51.29 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  53.02 
 
 		 317 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  51.7 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  47.37 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  50.16 
 
 		 317 aa  281  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  51.8 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  54.95 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  51 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  47.76 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  51.06 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 332 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  54.76 
 
 		 328 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  53.58 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  47.24 
 
 		 333 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  47.24 
 
 		 333 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  48.89 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  48.52 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  48.17 
 
 		 325 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  49.66 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  47.08 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  45.45 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  51.21 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  45 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  49.12 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  41.91 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 323 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 328 aa  219  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  41.41 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  43.48 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  40.33 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.75 
 
 		 622 aa  202  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.5 
 
 		 535 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 534 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45.99 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.36 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  42.48 
 
 		 624 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  40.98 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  40.4 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  44.64 
 
 		 586 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.66 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  40.52 
 
 		 472 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  38.94 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  38.44 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  39.45 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  39.45 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.25 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.25 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  42.24 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  36.77 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  39.64 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  39.72 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  41.11 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  45.16 
 
 		 276 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  37.65 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  38.16 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  37.62 
 
 		 315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  40.94 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  39.29 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  38.78 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  38.78 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  36.07 
 
 		 303 aa  169  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  38.14 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  34.6 
 
 		 311 aa  168  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 		 452 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.98 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  37.29 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 		 313 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  37.15 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  38.25 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  38.26 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>